Przebywanie przez pracownika na zwolnieniu lekarskim nie zawsze ochroni go przed rozwiązaniem stosunku pracy.
Nieobecność w pracy z powodu choroby jest usprawiedliwioną nieobecnością pracownika w pracy, o której mowa w art. 49 Kodeksu Pracy:
Pracodawca nie może wypowiedzieć umowy o pracę w czasie urlopu pracownika, a także w czasie innej usprawiedliwionej nieobecności pracownika w pracy, jeżeli nie upłynął jeszcze okres uprawniający do rozwiązania umowy o pracę bez wypowiedzenia.

Przepis wyraźnie wskazuje, że pracodawca w trakcie choroby pracownika nie może wypowiedzieć umowy o pracę co oznacza:
– pracodawca nie może złożyć oświadczenia o wypowiedzeniu umowy o pracę z zachowaniem okresu wypowiedzenia,
– pracodawca nie może wypowiedzieć warunków pracy i płacy tzw. wypowiedzenie zmieniające,
– pracownik może złożyć oświadczenie o wypowiedzeniu umowy o pracę z zachowaniem okresu wypowiedzenia,
– pracownik może rozwiązać umowę bez wypowiedzenia z winy pracodawcy,
– strony mogą rozwiązać umowę na mocy porozumienia stron,
– pracodawca może rozwiązać umowę o pracę bez wypowiedzenia z winy pracownika tzw. zwolnienie dyscyplinarne.

Pracodawca nie może złożyć oświadczenia woli o rozwiązaniu umowy o pracę za wypowiedzeniem w czasie trwania choroby . W praktyce często występowały sytuacje, gdy pracownik przyszedł do pracy, a po otrzymaniu wypowiedzenia uzyskał od lekarza zwolnienie od wykonywania pracy z powodu choroby obejmujące dzień, w którym złożono mu wypowiedzenie. Sąd Najwyższy uznał, że wypowiedzenie umowy o pracę pracownikowi, który świadczył pracę, a następnie wykazał, że w dniu wypowiedzenia był niezdolny do pracy z powodu choroby, nie narusza art. 41 k.p.

Jak wynika pracownik w trakcie choroby nie jest chroniony przed zwolnieniem dyscyplinarnym. Jednak pracodawca decydując się na rozwiązanie umowy o pracę bez wypowiedzenia z winy pracownika musi zachować przesłanki z art. 52 k.p, a w szczególności zachować miesięczny termin do złożenia oświadczenia liczony od uzyskania wiadomości o okoliczności uzasadniającej rozwiązanie umowy.